Eesti arstid on moodustanud mitmeid erialaseltse e erialaühendusi. Seltse moodustatakse tavaliselt kolmel erineval aluspõhimõttel. Esimesel juhul ühinevad arstid oma eesmärkide saavutamiseks kliinilise eriala põhjal. Teisalt moodustavad seltse ka arstid, kes tegelevad teatud kindla haiguse ravimisega või teatud diagnostika- või ravimeetodi rakendamisega.
Erialaseltside tegevus seisneb püüdes, muuta oma valdkonda eesrindlikumaks ja kvaliteetsemaks. Kaasa räägitakse erialale spetsialiseerumise korralduses, antakse välja ravisoovitusi ja korraldatakse erialakonverentse.
Erialaseltsid ei ole põhikirjajärgsed Eesti Arstide Liidu allasutused. Neid moodustatakse eraldi ehkki paljud erialseltside liikmed on ka Eesti Arstide Liidu liikmed. Järgnevas on toodud kõik Eestis tegutsevad erialaseltsid, kes tegelevad tõenduspõhise meditsiiniga. Seltsid on toodud tähestikulises järjekorras. Juhul kui seltsil on olemas koduleht on piirdutud viitega kodulehele. Koduleheta seltsidel on toodud kontakisiku andmed.
Eesti Artroskoopia ja Sporditraumatoloogia Selts
Eesti Bariaatrilise ja Metaboolse Kirurgia Selts
Eesti Erakorralise Meditsiini Arstide Selts
Eesti Gastroenteroloogide Selts riina.salupere ätt kliinikum.ee või benno.margus ätt itk.ee
Eesti Gastrointestinaalse Endoskoopia Ühing toomas.kariis ätt itk.ee
Eesti Hematoloogide Selts hematoloogia ätt gmail.com
Eesti Immunoloogide ja Allergoloogide Selts
Eesti Infektsioonhaiguste Selts
Eesti Kaitseväe Arstide Selts ahti.varblane ätt mil.ee
Eesti Kliinilise Neurofüsioloogia Selts
Eesti Kliinilise Toitmise Selts hanna-liis.lepp ät regionaalhaigla.ee
Eesti Kohtuarstide Selts heldi.kase ätt ekei.ee
Eesti Kõrva-Nina-Kurguarstide ja Pea- ja Kaelakirurgide Selts
Eesti Meditsiinigeneetika Selts
Eesti Naha- ja Suguhaiguste Arstide Selts
Eesti Nukleaarmeditsiini Selts sergei.nazarenko ätt regionaalhaigla.ee
Eesti Näo- lõualuude Kirurgia Selts
Eesti Onkoloogide Selts
Eesti Plastika- ja Rekonstruktiivkirurgia Selts olavi ätt kirurgiakliinik.ee
Eesti Seenior- Sisearstide Selts arvomesikepp ätt gmail punkt com
Eesti Torakaalkirurgide Selts ingemar.almre ätt regionaalhaigla.ee
Eesti Transfusioonimeditsiini Selts
Eesti Traumatoloogide-Ortopeedide Selts
Eesti Töötervishoiuarstide Selts
Eesti Veresoonte- ja Endovaskulaarkirurgia Selts
Eesti Veresoontekirurgide Selts
Ludvig Puusepa Nimeline Eesti Neuroloogide ja Neurokirurgide Selts